短程階段
       短程階段是指政研所籌備處設立後前三年，目標首先在建立核心研究團隊，而後逐年引進優秀的研究人員。在短期階段完成時，研究人員的總數為十名。此階段的目標是培養各重點領域的研究群組，作為政研所成立初期的研究骨幹。

中程階段
       中程階段是指短程階段結束後的十年成長期，目標在鞏固並擴大短程階段所培養的研究團隊，並視各重點領域的進展與需要，逐年增聘優秀的研究人員，以注入新血、創造活力。在中程階段完成時，政研所應有廿五位左右的專任研究人員，彼此密切互動，相互支援。同時推動跨所、跨學科與跨研究機構的合作，更積極開拓與世界第一流政治學研究機構的合作與交流，全面參與國際性的學術活動，並逐步建構東亞地區及新興民主國家間緊密的學術網路。

長程階段
       長期階段是指中期的十年成長階段完成後，政研所已經具有充沛的研究人力與完善的組織制度。此時政研所的規模將逐步發展到四十名專職的研究人員。在長期階段政研所的目標在充分發展利基、重點突破、追求卓越。至此，前述為國內奠定紮實的學術基礎，配合國家政治發展與因應兩岸關係快速變動的需求，在東亞地區扮演重要學術樞紐角色，以及在全球政治學界爭取一席之地的長程目標均可逐步實現。

        總之，中研院政研所的成立是中華民國政治科學發展的一個重要的里程碑，它肩負著提升學術研究水準與因應國家發展需求的雙重使命。為了達成此一使命，政研所的總體研究方向是「以理論為導向、以區域為基礎的比較政治與國際關係研究」。在此一總規劃之下，政研所初期規劃了五個研究群，並在徵聘人員與推動計畫上朝這五個重點研究方向努力。政研所將戮力追求學術卓越，並將其研究與國家民主政治的發展和兩岸與東亞的和平相結合，為台灣的政治科學做出醒目的貢獻。